Muziejaus veiklos sritys:
- muziejinę, istorinę ir gamtinę vertę turinčių eksponatų (mineralų, riedulių, jų kolekcijų ir dendrologinių kolekcijų) įsigijimas, tyrimas ir sisteminimas;
- mineralų, riedulių ir akmenų parko dendrologinių rinkinių, rodančių Lietuvos geologijos istoriją, žemės gelmių ir gamtos įvairovę, formavimas;
- sukauptų muziejinių vertybių apskaitos, tinkamo saugojimo sąlygų ir apsaugos užtikrinimas;
- muziejuje saugomų muziejinių vertybių sąlygų viešam naudojimui sudarymas (nuolatinių, kilnojamų ir laikinų ekspozicijų ir kitų renginių rengimas, straipsnių publikavimas);
- ekskursijų vedimas informuojant lankytojus apie racionalų žemės gelmių naudojimą, tvarios plėtros, gamtosaugines idėjas;
- regioninių, tarptautinių, Europos Sąjungos struktūrinių fondų ir kitų programų projektų ruošimas ir įgyvendinimas muziejaus plėtros, ekologijos, etnokultūros ir turizmo srityse;
- edukacinių programų vykdymas, paskaitų, parodų, publikacijų, seminarų, konferencijų rengimas;
- leidinių, spaudinių, suvenyrų, videofilmų, informacijos elektroninėse laikmenose, interneto svetainėse, parodose apie muziejaus veiklą kūrimas, rengimas, leidimas ir platinimas;
- neformaliojo vaikų švietimo vykdymas;
- muziejaus rinkinių apskaitos atlikimas Lietuvos integralioje muziejų informacinėje sistemoje (LIMIS);
- muziejaus pristatymas internete rengiant virtualias parodas;
- lankytojų aptarnavimo paslaugų plėtojimas;
- prekiavimas suvenyrais, leidiniais ir kita atributika apie muziejų, Skuodo kraštą, Lietuvą;
- informacijos mokslo įstaigų darbuotojams, visuomenei teikimas;
- kitos veiklos vykdant funkcijas, numatytas Muziejų įstatymo 9 straipsnio 2 dalyje.